
Bioinformatics meets Life Science: Berlin
Aktuelle Entwicklungen der Wissenschaft sowie Informationen rund um das Thema Bioinformatik stehen im Mittelpunkt des Thementages "Bioinformatics meets Life Science". Die Veranstaltung an der Charitè Berlin will Fachleute, Studenten sowie ein breites Publikum gleichermaßen auf die faszinierende Vielfältigkeit der Bioinformatik ansprechen.
Programm
Die Untersuchung von gewebespezifischen Unterschieden im mitochondrialen Proteom der Maus und die Aufklärung der Eigenschaften der Titinkinase sind dabei nur zwei Beispiele aus dem umfassenden Thema der subzellulaeren Proteomics, deren aktuelle Ergebnisse jetzt im Rahmen der Veranstaltungsreihe "Bioinformatics meets Life Science" in Berlin präsentiert werden.
11:00 Uhr - Begrüßung
Olaf Brenn, Kapelan Bio-Imaging GmbH, Halle/Saale
Subzelluläre Proteomics Bioinformatik in der Genomforschung
11:10 Uhr - Gewebespezifische Unterschiede im mitochondrialen Proteom der Maus
Sandra Techritz, Arbeitsgruppe Prof. Schülke, Campus Virchow Klinikum, Klinik für Pädiatrie mit Schwerpunkt Neurologie, Charité Berlin
11:30 Uhr - Lösungen in der 2D Gel-Elektrophorese
Tanja Kaan, Decodon GmbH, Greifswald
12:00 - 13:00 Uhr
Diskussion, Gespräche und Imbiss
13:00 Uhr - Using a proteomic approach to investigate the titin kinase signaling
Dr. Katy Raddatz, Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC) Berlin Buch
13:30 Uhr - 1D Gel Elektrophorese-Software LabImage
Olaf Brenn, Kapelan Bio-Imaging GmbH, Halle/Saale
14:00 Uhr - Sequenzierung von DNA und Proteinen (englisch)
Marianne Oerum and Charlotte Rasmussen, CLC bio, Arhus, Dänemark
ab 14:30 Uhr - Get Together mit Imbiss
Das Programm in Detail
11:10 Uhr - Gewebespezifische Unterschiede im mitochondrialen Proteom der Maus
Sandra Techritz, Arbeitsgruppe Prof. Schülke, Campus Virchow Klinikum, Klinik für Pädiatrie mit Schwerpunkt Neurologie, Charité Berlin
Die Arbeitsgruppe von Prof. Schülke arbeitet an der Erforschung neuromuskulärer Erkrankungen. Besonders betrachtet wird
die Mitochondriopathien - eine Multisystemerkrankungen die durch verschiedene Defekte in den Energie (ATP) produzierenden
Stoffwechselwegen der Mitochondrien verursacht wird. Die Dysfunktion jedes einzelnen dieser Gene kann potentiell zur
Mitochondriopathie führen. Vorgestellt werden die Arbeiten am mitochondrialen Proteom der Maus.
11:30 Uhr - Lösungen in der 2D Gel-Elektrophorese
Tanja Kaan, Decodon GmbH, Greifswald
Mit der Einführung des Image Warpings wurden Methoden entwickelt,
die mit der gesamten Bildinformation arbeiten und die Spoterkennung ans Ende des Analyse-Prozesses
stellen. Der Vortrag stellt die Kombination aus Warping und Bildfusion vor,
welche durch die Vermeidung von Matchingproblemen und Lücken die statistische Konfidenz
der Analyse wesentlich steigert.
Mehr Informationen zu Decodon finden Sie unter www.decodon.com
13:00 Uhr - Using a proteomic approach to investigate the titin kinase signaling
Dr. Katy Raddatz, Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC) Berlin Buch
Using a proteomic approach to investigate the titin kinase signaling:
Titin ist mit 3,7 MDa das größte Protein in Säugetieren und bildet neben Aktin und Myosin das dritte Filamentsystem im
Herz- und Skelettmuskel. Proteomanalysen zeigten, dass die Deletion der Titinkinaseregion eine Stressantwort im
Skelettmuskel und im Herzen auslöst, die zur Akkumulation von Hitzeschockproteinen und Untereinheiten des
26S-Proteasoms führt. Die Arbeiten und Ergebnisse werden vorgestellt.
13:30 Uhr - 1D Gel Elektrophorese-Software LabImage
Olaf Brenn, Kapelan Bio-Imaging GmbH, Halle/Saale
Die Software LabImage stellt neue Ansätze bei der qualitativen und quantitativen
Auswertung von 1D Elektrophorese Gelen vor. Mittels neuer Bedienkonzepte und einem
hohen Automatisierungsgrad können die Aufnahme und die Auswertung von 1D Gelen mit der
brandneuen workfloworientierten Software LabImage sehr einfach und ohne
hohen Einarbeitungsaufwand erledigt werden.
Mehr Informationen zu LabImage 1D 2006 finden Sie hier. Kostenfreie
Testversionen von LabImage erhalten Sie unter hier.
14:00 Uhr - Sequenzierung von DNA und Proteinen (englisch)
Marianne Oerum and Charlotte Rasmussen, CLC bio, Arhus, Dänemark
Die Lösung von CLC bio stellt die vollständigste und einfach zu bedienenden Softwaresuite
für Sequenzanalyse von DNA und Proteinen dar. Der Vortrag liefert eine Schritt für Schritt
Einführung in die Zusammenstellung von Sequenzdaten und Primer Design. Dabei wird ebenfalls
eine Lösung zur hardwarebeschleunigten Abfrage von Datenbankabfrage vorgestellt.
Mehr Informationen zu CLC Bio finden Sie unter www.clcbio.com.
Eine kostenfreie Version der CLC bio Software erhalten Sie hier.
ab 14:30 Uhr - Get Together mit Imbiss
Die Veranstaltung wird begleitet von einer Ausstellung folgender Firmen:
Kapelan Bio-Imaging: 1D Gel Analyse Software
www.labimage.net
Biostep: Bio-Imaging, PCR und Elektrophorese
www.biostep.de
Decodon: 2D Gel Analyse Software
www.decodon.com
CLC Bio: Sequencing Software für DNA und Proteine
www.clcbio.com
Bioinformatics meets Life Science wird ausgerichtet durch:
Kapelan Bio-Imaging
www.kapelan-bioimaging.com
BioCom AG
www.biocom.de



